CNR optimise en permanence les infrastructures du Port de Lyon afin qu'il dispose des meilleurs moyens pour faciliter la logistique fluviale des entreprises et l'activité des navigants. 700 bateaux accostent chaque année au Port de Lyon.
Les sociétés Logirhône (CFT) et Greenmodal Transport Barge affrètent des lignes fluviales régulières entre Lyon et Marseille/Fos. Chaque barge peut transporter 3 niveaux de conteneurs sur le Rhône et 2 niveaux sur la Saône.
4 navettes hebdomadaires de conteneurs :
Le site Inforhône et le serveur vocal 0 820 10 10 20, deux outils de communication de CNR, informent les navigants des conditions de navigation en temps réel sur le Rhône.
La capitainerie (04 78 61 65 78 / VHF canal 12) remplit une mission d'accueil des bateaux sur le port, de gestion du stationnement et de communication avec les mariniers. 24h/24, 7j/7 en contact avec les bateaux, elle connaît leur positionnement, répond à leurs sollicitations et active les bornes.